processding59.pdf - page 144

744
ðøĉ
öćèĒúąÙč
èõćó×ĂÜÿćøóĆ
îíč
ÖøøöìĊę
ÿÖĆ
éĕéš
ëĎ
ÖêøüÝÿĂïéš
ü÷üĉ
íĊ
ǰĂćÖćēøÿđÝúĂĉ
đúÙēêøēôøĊ
àĊ
ÿ
õćóìĊę
1
ÿëćîìĊę
đÖĘ
ïêĆ
üĂ÷Š
ćÜǰ(RY=øą÷ĂÜǰǰBK=Þąđßĉ
ÜđìøćǰMK=ÿöč
ìøÿÜÙøćöǰNK=îÙøýøĊ
íøøöøćßǰĒúąǰPT=ðŦ
êêćîĊ
)
2. Öćøđóĉę
öðøĉ
öćèéĊ
đĂĘ
îđĂđðŜ
ćĀöć÷ǰ
đóĉę
öðøĉ
öćèéĊ
đĂĘ
îđĂđðŜ
ćĀöć÷éš
ü÷üĉ
íĊ
óĊ
àĊ
ĂćøŤ
ǰ(PCR; Polymerase Chain Reaction) ēé÷ǰ20 ĕöēÙøúĉ
êøǰ×ĂÜ
ðäĉ
Öĉ
øĉ
÷ćóĊ
àĊ
ĂćøŤ
ǰðøąÖĂïéš
ü÷ǰ10 ĕöēÙøúĉ
êø
ǰ
KAPA
5BR
ready mix (KAPA) ìĊę
ñÿöđĂîĕàöŤ
ǰ
5BR
polymerase
(KAPABIOSYSTEM, USA) ĔîîĚĞ
ćÖúĆę
îïøĉ
ÿč
ìíĉĝ
ǰ7.4 ĕöēÙøúĉ
êøǰĒúąĔßš
ǰ0.4 óĉ
ēÙēöúǰ×ĂÜĒêŠ
úąĕóøđöĂøŤ
ìĊę
ĂĂÖĒïïđĂÜǰǰ
(Forward 5'-CAC GAA CCC ATT CAA ACA AG-3' ĒúąǰReversed 5'-AGT TTA CGA GTT TAG GGG GG-3') ĒúąéĊ
-
đĂĘ
îđĂìĊę
ÿÖĆ
éĕéš
ðøąöćèǰ10-20 îćēîÖøĆ
öǰìĞ
ćÖćøđóĉę
öðøĉ
öćèéĊ
đĂĘ
îđĂéš
ü÷đÙøČę
ĂÜǰMJ Mini
TM
(BIORAD, USA) ēé÷đøĉę
öÝćÖ
ÖøąïüîÖćøĒ÷Öÿć÷éĊ
đĂĘ
îđĂìĊę
Ăč
èĀõĎ
öĉ
95 ĂÜýćđàúđàĊ
÷ÿǰđðŨ
îđüúćǰ3 îćìĊ
ǰÝćÖîĆĚ
îđך
ćÿĎŠ
üĆ
äÝĆ
ÖøðøąÖĂïéš
ü÷ǰ
ÖøąïüîÖćøĒ÷Öÿć÷éĊ
đĂĘ
îđĂéš
ü÷Ăč
èĀõĎ
öĉ
ǰ95 ĂÜýćđàúđàĊ
÷ÿǰđðŨ
îđüúćǰ30 üĉ
îćìĊ
ǰÖøąïüîÖćøĔĀš
ĕóøđöĂøŤ
ÝĆ
ïÖĆ
ïÿć÷éĊ
-
đĂĘ
îđĂéš
ü÷Ăč
èĀõĎ
öĉ
ǰ58 ĂÜýćđàúđàĊ
÷ÿǰđðŨ
îđüúćǰ45 üĉ
îćìĊ
ǰĒúąÖøąïüîÖćøÿĆ
ÜđÙøćąĀŤ
ÿć÷éĊ
đĂĘ
îđĂĔĀöŠ
ǰéš
ü÷Ăč
èĀõĎ
öĉ
ǰ72
ĂÜýćđàúđàĊ
÷ÿǰđðŨ
îđüúćǰ45 üĉ
îćìĊ
ǰÝĞ
ćîüîǰ35 øĂïǰĀúĆ
ÜÝćÖîĆ
Ě
îÖĘ
Ĕßš
Ăč
èĀõĎ
öĉ
ÿč
éìš
ć÷ǰ72 ĂÜýćđàúđàĊ
÷ÿđðŨ
îđüúćǰ7 îćìĊ
ǰ
êøüÝÿĂïñúÖćøìĞ
ćðäĉ
Öĉ
øĉ
÷ćúĎ
ÖēàŠ
óĂúĉ
đöĂđøÿéš
ü÷ÖćøĔßš
ĂąÖćēøÿđÝúĂĉ
đúÙēêøēôøĊ
àĊ
ÿǰìĊę
öĊ
ÿŠ
üîñÿö×ĂÜđĂìĉ
đéĊ
÷öēïøĕöéŤ
õć÷Ĕêš
Öúš
ĂÜ÷Ď
üĊ
ǰñúñúĉ
êìĊę
ĕéš
ëĎ
ÖìĞ
ćĔĀš
ïøĉ
ÿč
ìíĉĝ
éš
ü÷óĂúĊ
đĂìĉ
úĊ
îĕÖúÙĂúǰĀøČ
ĂǰóĊ
ĂĊ
ÝĊ
ǰ[11] Ēúš
üìĞ
ćÖćøýċ
ÖþćúĞ
ćéĆ
ïđïÿéš
ü÷ǰBig
Dye reagent kit (ABI Prism
TM
Dye Terminator Cycle Sequencing Reading Reaction)
3. Öćøüĉ
đÙøćąĀŤ
ēÙøÜÿøš
ćÜóĆ
îíč
Öøøö
úĞ
ćéĆ
ïđïÿìĊę
ĕéš
ìĆĚ
ÜĀöéÝąëĎ
ÖîĞ
ćöćđðøĊ
÷ïđìĊ
÷ïēé÷Ĕßš
ǰsequencing alignment program ßČę
ĂǰCLUSTAL X [12]
ĒúąÿĞ
ćøüÝêĞ
ćĒĀîŠ
Ü×ĂÜúĞ
ćéĆ
ïđïÿìĊę
öĊ
ÙüćöĒðøðøüîìćÜóĆ
îíč
ÖøøöǰĒúš
üÝĞ
ćĒîÖĂĂÖđðŨ
îĒăēóúĕìðş
ǰóøš
ĂöìĆĚ
ÜĀćÙüćöëĊę
×ĂÜĒêŠ
úąĒăēóúĕìðş
ĀúĆ
ÜÝćÖîĆĚ
îĔßš
ǰDnaSP V.5 [13] ēé÷îĞ
ćĒăēóúĕìðş
ìĊę
ÝĞ
ćĒîÖĕéš
ìĆĚ
ÜĀöéöćüĉ
đÙøćąĀŤ
ÙüćöÿĆ
öóĆ
îíŤ
ìćÜóĆ
îíč
Öøøöéš
ü÷üĉ
íĊ
ǰphylogenetic analysis ēé÷Ĕßš
ǰDistance analysis àċę
ÜöĊ
øć÷úąđĂĊ
÷ééĆ
ÜîĊĚ
ǰđøĉę
öéš
ü÷ÖćøìéÿĂïĀćǰ
evolutionary model ìĊę
đĀöćąÿöēé÷Ĕßš
ēðøĒÖøöìĊę
ßČę
ĂǰModeltest [14] ĔîÖćøýċ
ÖþćÙøĆĚ
ÜîĊĚ
Ĕßš
ēöđéúǰT92+G [15]
ÙĞ
ćîüèĀćǰpairwise genetic distances Ēúš
üîĞ
ćöćÿøš
ćÜÿć÷ÿĆ
öóĆ
îíŤ
đßĉ
Üüĉ
üĆ
çîćÖćøǰēé÷Ĕßš
üĉ
íĊ
đîđïĂøŤ
ÝĂ÷îĉę
Üǰ(Neighbor-
Joining) õć÷Ĕêš
ēðøĒÖøößČę
ĂüŠ
ćǰMEGA6 [16] ìéÿĂïÙüćöđßČę
ĂöĆę
î×ĂÜēÙøÜÿøš
ćÜÿć÷ÿĆ
öóĆ
îíŤ
đßĉ
Üüĉ
üĆ
çîćÖćø ìĊę
ĕéš
éš
ü÷üĉ
íĊ
ǰ
bootstrap éš
ü÷Öćøǰresampling 1000 ÙøĆĚ
Ü
ñúÖćøüĉ
ÝĆ
÷ĒúąĂõĉ
ðøć÷ñúÖćøüĉ
ÝĆ
÷
úĞ
ćéĆ
ïđïÿïøĉ
đüèÙĂîēìøúøĊ
đÝĊ
÷îǰ376 ÙĎŠ
đïÿǰ×ĂÜðúćÝč
öóøüéǰ50 êĆ
üĂ÷Š
ćÜǰëĎ
ÖĔßš
ĔîÖćøüĉ
đÙøćąĀŤ
Ùüćö
ĀúćÖĀúć÷ìćÜóĆ
îíč
ÖøøöǰóïêĞ
ćĒĀîŠ
ÜđïÿìĊę
ĕöŠ
öĊ
ÙüćöĒðøðøüîǰ(monomorphic sites) ÝĞ
ćîüîǰ350 êĞ
ćĒĀîŠ
ÜǰĒúą
êĞ
ćĒĀîŠ
ÜìĊę
öĊ
ÙüćöĒðøðøüîǰ(polymorphic sites) ÝĞ
ćîüîǰ26 êĞ
ćĒĀîŠ
Ü
ǰ
öĊ
øĎ
ðĒïïóĆ
îíč
ÖøøöìĆĚ
ÜĀöéǰ21 øĎ
ðĒïïǰ(êćøćÜìĊę
1...,134,135,136,137,138,139,140,141,142,143 145,146,147,148,149,150,151,152,153,154,...300
Powered by FlippingBook